第二部: 研究生物武器的在战场上的使用，特别是在传播细菌和寄生虫的设备的研究方面。部长太田澄大佐。下设一个分部，下属一个航空班和在鞠家窑的安达特别实验场
八木泽班(植物菌):研究植物菌。班长八木沢行正陆军技师。
大田班(消毒):班长大田大佐。
第三部: 生产容纳生物战剂的炮弹，驻扎在哈尔滨。部长江口中佐，下设两个工厂，主要是陶瓷弹壳制造厂，用于生产"石井式"陶瓷细菌弹。还有一个运输班。
第四部: 生产各种生物战剂，部长川岛清少将。下设4课进行各证细菌的生产。
第1课
柄泽班:细菌制造 班长柄泽十三夫军医少佐
野口班:生产鼠疫菌和炭疽菌。班长野口圭一
