第二个世界也结束了呢

另选地方做最后的一场堂堂正正战斗来分出胜负

于是，这样一场扭曲的圣杯战争，就开始了

（↑以上为背景）

以下是基本流程大纲：

一开始，因为魔术师们的欺骗，让英灵们以为这不是一场勾心斗角，而是堂堂正正赢得胜利的圣杯战争，所以对master放松了警戒

主角察觉到master们的异状，但是其余servent（caster除外）并不太相信

由魔术师们许愿让魔术重现昔日的辉煌

但是，在最后的时刻，年轻魔术师爱丽丝背叛了所有人，想要许愿成为世界之王

击败魔术师后

在固有结界内，主角知道了年轻魔术师的故事

他本来只是想要让世人认可师傅（相泽桃）的魔幻小说（目的是让魔术以某种形式继续存在下去，即使没有魔术传承，但人们也能从魔幻故事中获得不一样的启发，使魔术最初的目的——帮助人们探索未知，能够延续下去）

齐格弗里德欺骗为阿咯琉斯，布伦希尔德将之误杀，随即也崩溃自杀。（炼金术夫妇的犹豫）

尼禄和晓美焰被master要求联手，之后击败了帕秋莉·诺蕾姬（该做的事情做完了，回红魔馆去了），然后因为主角是由帕秋莉·诺蕾姬提供魔力的“架空英灵”而没有人再重视她。

之后的战场，由尼禄、晓美焰和娜娜莉参加。

master们事先在娜娜莉的宝具（科幻机甲，所以以当时的科技水平要做手脚太简单了），尼禄和晓美焰在不知情的情况下，击败了娜娜莉

察觉的有些不对尼禄和晓美焰决定再做准备

可是，年轻人在小时候中因为表演真正的魔术受到同龄人的欺负（因为科技发达已经完全能轻易做到这些），结果行事开始逐渐变得偏激

最后，爱丽丝认为只要成为“王”，就能使世人承认师傅

但是，他没有能够颠覆世俗的力量

在翻阅古代传下来的典籍中，他找到了圣杯战争的记录

再由于霍恩海姆夫妇发明了人工灵脉